Graduado pela Faculdade de Medicina de Catanduva (FAMECA – Catanduva/SP), com especialização em Oftalmologia, pelo Hospital de Olhos Redentora, em São José do Rio Preto/SP, o Dr. José Dante Baboni Junior possui Título de Especialista pelo Conselho Brasileiro de Oftalmologia e Associação Medica Brasileira.
Entre os treinamentos na sua especialidade, destaque para o Curso Básico Unificado de Oftalmologia pelo Hospital das Clínicas – USP, São Paulo/SP, onde também concluiu cursos práticos e integrados em Cirurgia de Catarata e Cirurgia Refrativa. Pelo Hospital de Olhos Redentora, São José do Rio Preto/SP, realizou fellowship em Segmento Anterior, com ênfase em Cirurgia de Catarata, Cirurgia Refrativa a Laser, Glaucoma e Ceratocone (lentes especiais, transplante de córnea e anel de Ferrara).
É integrante da Sociedade Brasileira de Oftalmologia; Conselho Brasileiro de Oftalmologia; Sociedade Brasileira de Cirurgia Refrativa; Sociedade Brasileira de Catarata e Implantes Intraoculares; Sociedade Brasileira de Lentes de Contato (SOBLEC); Sociedade Caipira de Oftalmologia (SOCA); International Society of Refractive Surgery; American Academy of Ophthalmology; American Society of Cataract and Refractive Surgery (ASCRS); International Intraocular Implant Club (IIIC).